鋼鉄の檻、海嶺市。人々は都市OSを司る**〈祈り姫〉**の祈りに縋り、思考を放棄した安寧の中にいた。 元工作員の運び屋・ミコトが請け負ったのは、神の権能を模倣する禁忌のコード《天之神火之咲夜写巻》の運搬。その傍らには、過酷な代償を払い未来を観る少年・こばとの姿があった。 二人の前に立ちはだかるのは、姉である祈り姫を守るため、汚れ役の騎士と化したマーラ。そして、「自由という毒」から民衆を守るために絶対的管理を強いる支配者、五福星の男。 「運ぶ道具」でしかなかったミコトは、逃走の果てに自らの意志で巻物を開く。 彼女が世界に叩きつけたのは、甘い救済ではない。 自らの足で荒野を歩くという、残酷なまでに美しい「責任」だった。 神様が祈るのをやめたとき、人々は初めて、自分の名前で一歩を踏み出す。 これは、英雄であることを拒絶した少女が、壊れた世界の再起動（リブート）を宣言する物語。