平穏で安寧な日々は、前触れもなく静かに変容していった。謎の物質“悪意”によって人々の理性が密かに壊されていく。ある事をきっかけに特殊な力に目覚めた高校生、長永頼人と幼馴染みの獅子川花凛は悪意を根絶するために人知れず戦う。しかし、戦うのは悪意だけではない。頼人たちと同じく力に目覚めた者や、“妖怪”と呼ばれる存在、そして悪意の裏に潜む者……２人の前には多くの敵が立ち塞がる。いくつもの困難を乗り越え、２人は少しずつ成長していく。