羽山小学校に通う5年生の竹澤尊、石谷謙三、桃谷門田の三人組には、誰にも言えない秘密の場所があった。それは、山奥にある古い二階建ての廃屋を自分たちで改造した《秘密基地》の存在だ。 ある土曜日の午後。いつものように秘密基地に集まっていた三人の頭上で、突如として空間がガラスのように割れ、巨大な鋼鉄の塊が落下してくる。それは、次元の狭間で《次元獣》と戦い敗れた、次元超人が操るゾーンG(グレート)ロボだった。 深手を負い、もはや戦う力の残っていない次元超人は、困惑する三人の少年に告げる。 「この世界の未来を、君たちに託すしかない――」 次元超人から授けられた黄金のガジェット《ゾーンブレス》。その光に呼応するように、古びた廃屋は一変し、三機の次元マシーンを格納する《ゾーン・ハイド・ベース》へと姿を変えた。 平和な日常の裏側で、次々と次元の裂け目から現れる不気味な《次元獣》たち。 熱血漢の尊(たける)、天才の謙三(けんぞう)、怪力の門田(もんた)。性格もバラバラな11歳と10歳の少年たちは、時にぶつかり合い、時に悩みながらも巨大ロボを操り地球を《次元獣》の魔の手から守る戦いに身を投じていくのだった――。