「魔力こそが正義」――それが、最高学府である帝国立魔導院「アトラス」の絶対的な法だ。 魔力を持たない少年シキは、学園のカースト最下層で設備の修理に明け暮れる日々を送っていた。 しかし、彼には誰にも知られていない秘密があった。 彼は魔力を持たない代わりに、星の魔法OSそのものにアクセスできる管理者権限――『虚数回路』を持つ、世界唯一の「魔導技師（チューナー）」だったのだ。 一方、学園の頂点に君臨する『五大元素』の乙女たちは、強すぎる魔力の代償として、常に暴走と自壊の危機に晒されていた。 高熱に焼かれ、拒絶反応に震え、孤独な静寂に怯える彼女たち――。 そんな「欠陥品」と蔑まれる最強の魔女たちを救えるのは、魔力を持たないシキの「指先」だけだった。 「少し弄るぞ。……我慢しろ、脳が溶けるぞ？」 シキが彼女たちの魔力回路に直接触れ、その「バグ」を書き換えるたび、凄まじい激痛は甘美な快楽へと反転していく。 一人、また一人とシキの指先の虜になり、陥落していく学園の美少女ランカーたち。 やがてシキは、彼女たちを引き連れて学園の絶対序列を塗り替え、国家の陰謀、そして世界を管理する「システム」そのものへと牙を剥いていく。 これは、魔力ゼロの底辺技師が、壊れかけの最強魔女たちを「修理（メンテナンス）」して、自分だけの楽園を築き上げる物語。