「僕はこの世の馬鹿極まりない心霊現象を、暗号解読で否定する。まア、気が向いたらね」

大正時代末期、東京銀座。
街は心霊現象が囁かれ、溢れかえっていた。
そんな心霊が関与する事件を暗号解読によって解決し否定していく、かつて政府直属の暗号解読者だった天才青年・有島。
そんな有島の唯一の助手となった、真面目で献身的な毒舌エリート大学生・柳原。
自由奔放で傍若無人！気まぐれな解読者と引っ込み思案な学生が『暗号』を武器に、周囲を振り回しながら摩訶不思議な依頼に挑む。