舞台は第1部終了から5年後。「アイズ」の目的は時の流れを見張ることである。しかし、タイムトラベルした時間犯罪者による歴史介入で改変された世界から、不当な圧力を取り除く「時の修理屋」が存在した。彼らは見張るのではなく、クロノアイズ・グランサーとは呼ばれ、悪を射る「視線」であった！