物の怪や都市伝説的存在、妖怪や祟り神などを総じて、一般人が関わってはならない存在、禁忌核と呼ぶ。 その禁忌核に対抗するために、古代日本で神道や陰陽道といった神秘の使い手、建築や鍛冶に農業など様々な分野の技術者、そして武具の扱いや戦の指揮等の戦いなど、その道のエキスパートを集めた八咫烏が組織さた。 彼らは禁忌核から日本国及び国民の保護のために、古来より一般人の目に留まらないところで活動をしていた。 時は流れ現代。十九歳の海風 平八は、フリーターとして日雇いの仕事をしつつ先祖代々の土地で時折畑仕事をこなし、住処は曽祖父から受け継いだこれまた先祖代々の家で一人暮らしと、質素な生活を送っている青年。 真面目さと我慢強さがが取り柄、特技は土を耕すことな健全な平民。自身をそう語る彼のもとに、あるとき一人の少女が訪ねる。 平八は自身を八咫烏に召集すると語るその少女とともに、脅威である禁忌核との戦いに身を投じることになるのであった。