都心から離れた郊外にある三咲市には20年以上前からダンジョンと呼ばれる建造物が存在し、中には価値のある人工物や工芸品が眠っているが、そこには人間を襲うモンスターの存在も発見されている。三咲市に住む少年、川崎紅葉（かわさきくれは）は幼少の頃に彼だけが扱える能力を所持しているにも関わらず、ダンジョン攻略の育成学校の試験で無能の烙印を押されてしまう。 双子の妹、真凪夏（まなか）との約束を果たすため、紅葉は日々、地獄のような毎日を送っていく。