魔導技術と呼ばれる魔法の科学技術が存在する世界。 フレナリア聖国の辺境で暮らす捨て子の少女ゼアフィーズは、育ての親であるシスターに恩返しするため、病弱ながらも一人前のシスターになるべく奮闘する毎日を送っていた。 しかし、その平和はグラギアド魔導帝国の侵攻によって崩れ去る。 ”愛は世界を救う”――そう信じてきた教えは、魔導技術で造られた人型搭乗兵器「魔導機兵」の前では無力であり、人々は次々と命を奪われていく。 教えは否定され、あまりにも無力な自分に絶望するゼアフィーズ。 そんな彼女の前に現れたのは、「フェネクス」と名乗る謎の巨人――。 その正体は、古代文明が作り出した人工生命体だった。 愛の力を見失いかけた少女と、純粋無垢な機械少女。 二人の出会いが導くのは破滅か、それとも希望か――。 ガール・ミーツ・ガールで紡ぐSFファンタジー、ここに開幕！