舞台は海上学園都市「オーケストラ」。 この世界では、思春期の少年少女の「魂の波長」が物理干渉力を持つ異能《共鳴音（レゾナンス）》として発現する。 •能力者は「演奏者（プレイヤー）」と呼ばれ、その強さは「感情の強さ」に比例する。 しかし、感情が高ぶりすぎると波長が乱れ、理性を失い破壊衝動の塊である怪物《不協和音（ノイズ）》化してしまう。 あらすじ 異能《共鳴音（レゾナンス）》の力が全てを決める学園都市「オーケストラ」。そこに入学した主人公・九条カナタは、異能の出力を一切持たない測定不能のイレギュラー、通称「無音（サイレント）」としてFランク（最底辺）のレッテルを貼られていた。 周囲から無能と蔑まれるカナタだが、彼には隠された唯一無二の能力があった。それは、暴走寸前の能力者の波長に干渉し、強制的に沈静化・増幅させる《調律（チューニング）》の力。 ただし、その《調律》を行う条件は、「相手の心（トラウマや本音）に深く触れ、互いの波長を同調させること（＝精神的・肉体的接触）」だった。