蒼月凛は、平凡な日常だけを望む高校生。 しかし彼は、生まれつき“原初（オリジン）”と呼ばれる危険な能力を秘めていた。 それは――戦えば戦うほど強くなり、やがて人間性すら失ってしまう進化の力。 力を隠して静かに生きようとする凛の前に現れたのは、 凛の進化を唯一抑えられる特殊な血を持つ“姫巫女”・白音夕奈。 彼女は凛を暴走から守るために派遣された存在だった。 だが凛の力を狙う過激派組織《牙城》と、 原初を国家レベルで監視しようとする《監査局》が動き出し、 凛と夕奈の平穏は粉々に砕かれる。 戦えば強くなるほど、凛は“人間”から遠ざかっていく。 それでも夕奈は、命を削りながら彼を止め続ける。 平穏を望む原初の少年と、彼を救う姫巫女の少女。 二人の出会いが、世界の運命を大きく変えていく――。