シガンシナ区の孤児院で暮らす少年、べレス・アッカーマン。夕暮れの街に漂う異様な気配に胸をざわつかせる彼の前に、突如として超大型巨人が出現。街は一瞬で破壊され、孤児院も瓦礫と化す。 避難船に乗り込んだべレスは、生き延びた人々の悲鳴と絶望の渦に囲まれながらも、胸の奥に不可解な衝動を覚える――それは、戦いの感覚と殺意を知る前世の記憶の片鱗だった。 避難船の上で、もう一人の少年、エレン・イェーガーがの叫びを聞く。怒りと決意に燃えるエレンの声に、べレスは自身の内に眠る未知の力と運命を強く意識する。 これは、壁の崩壊と巨人の襲来に巻き込まれた少年たちの、命と戦いの物語の始まり――。 赤く染まる夕暮れの街で、べレス・アッカーマンの運命は静かに動き出す。