世界最強の暗殺者である黒崎唯人（くろさきゆいと）。 そんな彼は、ある日突然ボスに学園への潜入を命じられ、生徒として通学することに。 武器は器用に扱うが、人との関わりでは不器用な唯人。 学園で出会った個性豊かな仲間たち。 そして、唯人に思いを馳せる少女たち。 唯人の学園生活は一体どうなるのか…？