かつて「魔導工学」で繁栄した超古代文明アトラシア。その遺構の一つ──遺跡都市エリュシオンで目覚めた青年カイは、前世の知識を思い出す。彼の脳内に響くのは、無限知性体「OS（オムニ・システム）」の声。 「システム再起動を開始します──ユーザー、カイ＝アーヴェント」 不遇の魔導学徒として学院を追放された彼は、失われた人工知能技術と魔法理論を融合させ、滅びかけた世界の再構築を始める。時代が追いつけなかった天才の反逆が、神々すらも巻き込む文明再生の物語となる──。