魔法少女──それはかつて世界を守った英雄の象徴。 しかし時代は変わり、魔法も怪異も過去の遺物となった。 高校生・雨ヶ谷凛が引っ越してきたその日、 隣家から聞こえたのは、奇妙な破裂音と老人の悲鳴だった。 倒れていたのは、白髪交じりの中年女性・宮代ミサ。 彼女こそ、二十年前に世界を救った“最後の魔法少女”だった。 「もう戦うことなんて無いと思ってたんだけどねぇ……まさか、あんたが見ちゃうなんて」 ミサの魔力が凛に触れた瞬間、 封じられていた“異形（シャドウ）”が再び動き始める。 世界の裏で何かが蠢いている。 そして、ミサの力の残滓は──なぜか凛の身体に反応した。 男のまま、少女の系譜を継ぐ“中性的な魔導戦士”に変身する凛。 かつて英雄だったミサは、もう一度立ち上がる理由を思い出していく。 これは、老いた魔法少女と新米男子高校生の、 消えかけた光を取り戻す再生と成長の物語──。