時は聖暦202年、ここは異世界ヒノモト国。 ヒノモト国は今、謎の組織「邪刀」と妖怪たちの脅威にさらされていた。 立ち向かうは彼らに対抗しうる力を持った乙女たち「妖撃隊」。 これから話しまするは、幕府を担う将軍となる運命を背負った少女に拾われた大悪人の娘が、 妖撃隊として妖怪たちと戦い、やがてヒノモト国を救う英雄に成長するまでを描いた物語です。