鎖国中の日本。 異国の船が立ち寄れるのは、長崎の出島のみ。 夜、出島に入港してくるボロボロで今にも沈みそうな船が一隻。乗組員は、骸骨である。そう、船は幽霊船なのである。 幽霊船に乗ってやって来た異国のあやかしたちは、入国審査のために、日ノ本へやって来た理由を語る……。