古い書庫の奥で、紙面を海に進む潜水艦〈リヴァイアサン〉と〈ノーチラス〉が激突。魚雷で文字がしぶきとなり物語が変容し、苗木や波獣、土巨人などが生まれる。索引圏で宿敵と対峙し、読者の登場で文字精霊が力を得る。やがてページが閉じられ、すべては消え、再び開かれる時を待つ。