引きこもりの社会人・原林章は、ある日アパート前で倒れていた二人の少女を拾う。科学都から追放された式神のテッチャンと、その式である無邪気な設樂。奇妙な同居生活は、孤独だった章の世界に温もりをもたらしていく。だが日常の中で、設樂の体に小さな異変が現れ始める。やがてそれは、現実と科学都を揺らす大きな運命へと繋がっていく――。