アークウェル魔法学園―― その華やかな校舎の裏では、数々の事件が記録から消され、真実は闇に葬られていた。 裏生徒会《Shadow Council》――学園の歴史さえ操作する秘密組織が暗躍している。 一年生クラリス・ナイトフォールは、魔力ゼロのため誰もが落ちこぼれ扱い。 しかし彼女には、魔法痕跡（レジデュ）を読み解く能力があった。 この力こそ、幼少期に封印された才能の一部だった。 ある日、正規生徒会長のレオンにスカウトされ、クラリスは表向き風紀委員、実態は裏生徒会の隠された犯罪を暴く秘密捜査官として活動を始める。 魔法が使えないことはハンデではなく、むしろ“切り札”。 解析眼と知略を駆使し、裏生徒会の罠や策略を読み解く。 同時に封印されていた魔力も徐々に目覚め始め、彼女の成長と学園の運命は交錯していく。 魔法×学園ミステリー×知略戦。 弱さを力に変える少女の戦いが、いま始まる――。