高校二年生の日向悠馬は、両親の海外赴任により居場所を失う危機に直面する。 彼の救いとなったのは、幼馴染みの椎名結月が同居することを条件に、学校が管理する女子生徒限定のシェアハウス「ステラハウス」への特例入居が許可されたことだった。 ​住人会議では生徒会長の藤咲葵や留学生のフィアナに賛同されたものの、優等生の神楽坂凛と人気アイドルの櫻庭琴音からは反対され、悠馬の共同生活は緊張感のあるスタートを切る。 ​そして入居初日の夜、彼は養護教諭の佐倉理恵先生からこの特例入居の「交換条件」として、誰にも言えない極秘の任務を与えられる。 ​それは悠馬の部屋のクローゼットの奥に隠された秘密の地下通路を使い、資料庫を管理すること。 しかし、その通路は共用脱衣場や反対派のヒロインたちの部屋の真下に通じるという、構造的な欠陥を抱えていた。 ​「もし万が一、ラッキースケベな状況に遭遇しても、私は何も見なかったことにするわ。だから、ほどほどにしてね」 ​佐倉先生の寛容な一言と裏腹に、悠馬は知らず知らずのうちに、彼女たちの無防備な姿や誰にも見せていない素顔、そして秘密を目撃してしまう立場となる。 ​楽しい共同生活という表の顔と、誰にも言えない秘密の任務という裏の顔。 悠馬は秘密の通路がもたらすドキドキの日常の中で、五人の美少女たちとの関係を深めていくことになる。