:: 목에 점이 없으면 사람이 아니다. 과학이 고도로 발달된 도시, 주인공은 목에 점이 없다. 이 탓에 어린 시절부터 '클론'으로 취급 당하며 과학자들에게 붙잡힌다. 유년기와 청소년기 대부분을 실험실에서 보낸 주인공. 어느 날 의문의 폭격으로 연구소가 무너지고 홀로 살아남게 된다. 홀로 남은 주인공은 연구원 R-001의 연구 일지를 보게 되는데…