냉전 중반, 미국은 소련을 견제하기 위해 전투용 복제인간들인 '클로노스'를 만든다. 클로노스는 인간들보다 강한 신체능력을 가지고 있었으며 초능력을 사용할 수 있었다. 소련이 쇠퇴한 이후에도 복제인간들은 여러 전장에 투입되었고 인간들이 내리는 명령도 충실히 따르는 것처럼 보였다. 그러나 내면 깊숙이 상당수의 클로노스는 창조주에 대한 반감을 품고 있었다. 결국 은밀하게 세력을 키워온 복제인간들은 반란을 일으켰고, 인류는 예기치 못한 공격에 제대로 대응하지 못한 채 순식간에 몰락한다. 세계의 지배자가 된 클로노스는 거대한 군대를 조직해 인간들을 사냥하고, 소수의 생존자들은 은신처에 숨으면서 클론들에게 저항한다. 하지만 살인을 위해 만들어진 복제인간들인 클로노스에게 한낱 인간에 불과한 생존자들이 저항하는 건 쉽지 않았고 상황은 더욱 악화되어 갔다. 그렇게 30년 동안 처절한 투쟁을 이어가던 인간들은 어느 날 어떤 연구소에서 동면 중이었던 한 클로노스를 발견하게 되는데...