西暦2070年代。環境危機が深刻化し、人類が時間軸の観測に踏み込んだ世界。結城律（ユウキ・リク）は、超国家研究機関クロノス・インダストリーに所属する若き天才科学者。彼は愛する恋人水無瀬月凪（ミナセ・ルナ）を突如、不慮の事故で喪うという残酷な運命に直面する。 絶望に打ちひしがれた律は、自らが開発に携わった時間観測技術「過去への干渉」その禁断の力を使って月凪を取り戻すことを決意する。 だが、彼が研究に没頭する中、目の前に亡き月凪に瓜二つの女性が現れる。彼女の登場は、律の知る世界の前提を揺るがし、やがて時間軸全体を巻き込む壮大な陰謀へと発展していく。 律は愛する女性の死の真相と、世界を意のままに操ろうとする巨大な力に立ち向かい、未来、過去、そして並行時空を超えた、人類の運命を賭けた戦いに挑むことになる。