大ゲルマン帝国の首都ゲルマニア（旧ベルリン） 独ソ戦でナチス・ドイツが勝利した世界。帝国は広大な領土を支配するが、内部では経済悪化と東部占領地の反乱により、崩壊の危機に瀕している。核抑止による「交和（膠着状態）」が続き、米独の冷戦が継続中。 生粋のゲルマン人エリート家庭出身のルカ・シュミット（10歳）は、訓練施設で謎の薬剤投与を受けていたが、副作用で手が震え始め、成績が急落。教官から「クナカ（ガラクタ）」と侮蔑される脱落候補となる。 一方、2018年にイギリスから亡命してきたイレーヌ・アダムスカ（13歳）は、機密情報を手土産に帝国の信頼を勝ち取り、薬剤に完全適応した優等生だった。彼女はルカを励まし、最終評価試験で密かに助ける。 ルカは合格し、「クナカ」という蔑称を誇りに変える決意をする。二人は共に「アダムとハヴァ計画」に選ばれた――人と怪物の融合による新人類創造のための人体改造計画だ。 訓練の過程でルカは労務区域（スラブ系住民の強制労働地域）の悲惨な現実を目撃し、国営プロパガンダとの乖離に苦悩する。 二人は計画を生き延び「神の子」として認定される。 そして──再会したイレーヌは、ルカだけに真実を告白する。