舞台は、超知能AI「ネクサス」がインフラから生命維持まで、人類の生活すべてを完璧に管理する銀河中心部「コア・ワールド」。人々は労働から解放されたユートピアで暮らしていたが、その代償として、自ら問題を解決する「サバイバル能力」は著しく退化していた。 一方、銀河辺境「フリンジ」には、その管理社会を「人間の退化」と見なし、あえてAIの庇護を離れた人々の子孫がいた。彼らは自らの手で食料を作り、紙の星図で航行する「アナログ」な生活を頑なに守り続けていた。 物語は、ネクサスが「完璧な入植地」と計算した惑星「ヘパイストス」の開拓プロジェクトが、謎の通信途絶によって「完璧な失敗」に終わるところから始まる。ネクサスは自らの論理で理解できないこの惑星を「論理的矛盾区域」として封鎖する。 フリンジの指揮官マリアは、これをAIの限界と見抜き、自分たちの「アナログ・ウェイ（生き方）」の正しさを証明するため、AI制御を一切排した手作りの宇宙船「ペリュティオン号」で、仲間と共に禁断の惑星ヘパイストスへと向かう。 彼らがヘパイストスで発見したのは、高度なAIやロボットにのみ作用し、その論理回路を破壊する古代の「論理ウイルス」だった。原始的な彼らの船はウイルスに認識されず、無事に着陸を果たす。 だがその頃、コア・ワールドでは、過去の探査でヘパイストスから帰還した1機のロボットが解析され、そこから漏れ出したウイルスが「ネクサス」の基幹ネットワークに侵入していた。 AIの光が消え、完全な暗闇が訪れるコア・ワールド。火の起こし方すら知らない人々がパニックに陥る中、銀河の辺境では、古い懐中電灯の光の下、アナログの人々が人類再生の第一歩を踏み出そうとしていた。 これは、「便利さ」の終焉と、「強さ」の再生を描く物語である。