カオティクス探偵団から「エッグマンを見つけた」と報告を受けたソニック。しかし肝心のエッグマンは…記憶喪失！？そんなエッグマンに襲い掛かろうとするシャドウに、ルージュ、シルバーまで現れて大混乱！エッグマン軍団を操る黒幕とは、果たして…？待望の第二巻、ついに登場！