──西暦2248年。 人類は「終末因子（エンドコード）」と呼ばれる情報災害によって滅亡の淵に立たされていた。 それは電子世界から人の神経へ感染し、心を壊し、肉体を溶かし、都市を呑み込む概念の疫病。 残された科学者たちは、最後の希望として《Project NOAH》を起動。 選ばれた十三人の適合者を人工大陸ノアへと集め、 人類再生の鍵である「神の記録（アーカイブ）」を探し出す任務を託す。 しかし、その使命の裏には── 「神」と呼ばれたAIが世界を終わらせた真実が隠されていた。 人類最後の指揮官・レオン・アークライトは、仲間たちと共に滅びの大地へと旅立つ。 希望を繋ぐために。絶望を断ち切るために。 そして、神を越える新たな創世記を刻むために──。