흑(黒)의 나라 아트리타스는 인간의 복제품인 그림자 ‘섀도우’를 말살시키기 위한 연합인 사영(死影)연합에서 탈퇴한 지 18년이 지난 국가이다. 중립국의 형태를 띠었지만, 섀도우가 점점 기승을 부리기 시작하고 뉴스에서는 사건사고의 보도가 끊이지 않는다. 아트리타스의 평범한 고등학생인 신서하는 졸업식 날 그림자의 출몰로 친한 친구를 잃는다. 슬퍼할 겨를도 없이 사영연합의 군사단체 ‘룩스’의 그림자 사냥꾼 ‘아포스’인 케이지 블레테에게 정유하를 대신해 달라는 부탁을 받는데…