時は二十二世紀の日本。技術力は今我々が生きる二十一世紀とほとんど変わらず、今の我々と大して変わらない生活を送っていた。だが、そんな状況が突然、一変する。 日本に出所不明の妖怪が突如大量に現れた。妖怪たちは無惨にも人間を大量に虐殺していった。 日本政府はすっかり妖怪たちに怯え、妖怪側に有利、つまり人間側に不利な条約を結んでしまい、妖怪は人間を殺し放題となり、たくさんの命が奪われていった。 そんな妖怪たちに親を殺された一人の少年は、天涯孤独となり、自分の親を殺した妖怪へ復讐するために、妖怪の殲滅を目指す組織に入ることとなる……。