2059年、未来都市「ネオ・武蔵」。鋼鉄とネオンに覆われたこの世界に、戦国時代の剣士・榊原宗影（さかきばら むねかげ）が時空を超えて現れた。彼は過去の記憶をそのままに持ち、だが現代の記録ではすでに死んでいる存在だった。 そんな折、かつての戦乱の亡霊たちが次々と現れ、未来の東京を滅ぼそうと牙を剥く。混沌に包まれた街を守るため、宗影は己の武士道を貫き、亡霊たちと激しい戦いに身を投じる。 朧藩の誇りと魂を胸に、彼は時代を超えた敵に立ち向かい、未来の東京の命運を懸けた戦いを挑む。