世界中に突如として出現した一万のダンジョン。 日本には二百あまり、そのひとつが東京・新宿の地下に現れた。 平凡なサラリーマン・神崎蓮は、ある朝“ダンジョンマスター”に選ばれる。 与えられたのは100日の準備期間と、1000DP。 ダンジョンを構築し、侵入者を迎え撃ち、生き残れ。 ダンジョン同士が争い、国家が手を出せない新たな秩序が生まれる中―― 蓮は東京の地下から、世界の裏側へと手を伸ばしていく。