物語は、天界の三大神の一人であるヒロを中心に展開する。 彼と、他の二柱――カムイとヤスオ――は、「全能の存在」による束縛から逃れ、自由な生を謳歌するため、人間界へ降り立つ計画を立てた。 三人は地上で「竈門（かまど）」という家名を名乗り、1930〜40年代の日本で暮らしていた。 さらに、彼らには末妹のシミー・カマドとサミー・カマドという二人の妹がいた。 その後、ヒロは5年間のアメリカ滞在を経て、シミーと彼女の友人ジンと共に東京へ帰還する。 しかし、彼らの住む地区が政府の命令で封鎖されるという事態に直面する。 封鎖に反対する中で、ヒロたちはシミーの幼なじみであり、ヒロに密かに想いを寄せていた少女――ミナモト・ソフィア――と再会する。 だが、地区封鎖をめぐる衝突が原因で、ヒロたちはアメリカ軍から追われる身となってしまう。 こうして彼らは、アジアからヨーロッパ、そしてアメリカへと渡り、助けを求める旅に出るのだった。