世界は謎の組織「ブランク」によって色を奪われ、人々は“無彩”の世界で生きることを強いられていた。 そんな中、弱いパステルカラーしか扱えない少女・色染 彩葉（しきぜん いろは）は、奪われた色を人々に還す力を持ち、仲間と共に旅をしていた。 仲間は、冷静沈着な青の使い手・藍原 湊（あいはら みなと）、 豪快な赤の使い手・朱崎 烈（あかさき れつ）、 影のように現れる黒の使い手・烏丸 夜凪（からすま やなぎ）、 そして科学者で黄の適性を持つチート改造パレット使い・金城 理斗（かねしろ りと）。 色を取り戻す戦いの果て、物語は、まだ誰も知らない色へと向かっていく。