2016年2月　高校三年生の少年・沖田総次は、合格発表に向かった東京の有名私立大学で数えきれない程の死体が転がる地獄絵図を目の当たりにした。戸惑いと混乱で心が乱れる中、彼らを惨殺した「ＭＡＳＴＥＲ」と名乗る賊が総次を見つけて襲い掛かる。覚悟を決め、護身用にと持ってきた竹刀と剣術で危機を脱しようと奮闘する総次を助けたのは、新選組の羽織を着た二人の女性だった。 　彼らは「新戦組」　対ＭＡＳＴＥＲの為の私設武装集団として「闘気」と呼ばれる強大な異能力と武術を駆使し、水面下で警察と共にＭＡＳＴＥＲと死闘を繰り広げている組織だった。その局長は、彼が幼い頃に姉のように慕っていた女性だった。彼女を補佐する女性副長は総次の卓越した剣技と闘気を評価し、いきなり一部隊の隊長を任せようとする。 　 　実力を測る為に執り行われた局長との模擬戦を経て、隊員達に認められる為の部隊長代理としてテスト期間を過ごす中、ＭＡＳＴＥＲは更なる騒乱を巻き起こす。総次は否応なしに戦場に身を置き、命がけの日々を過ごすことになる。 　だがこの時の総次は知らなかった。そのテロ組織「ＭＡＳＴＥＲ」に、昔の総次をよく知る人物がいることを……。 ※2020年4月30日、あらすじとキャッチフレーズを編集しました。 ※2020年5月7日、第1部の第1章・第1話冒頭部分を変更しました。 ※この物語はフィクションであり、法律・倫理に反する行動、特定の団体への誹謗中傷を容認・推奨するものではありません。