突如、日本全土が謎の霧に覆われ、魔物が出現。近代兵器は無力化され、文明は崩壊した。 人々が絶望する中、大学生の佐久間（さくま）リョウジは謎のスキル『文明リセットLv.1』を手に入れる。 それは「視界内の人工物を指定した時代の状態に戻す」というとんでもない能力だった。 リョウジは生き残るため、そして家族を探すため、この力を駆D駆使することを決意する。 銃が効かないなら、江戸時代の技術（たたら製鉄）で魔物の嫌う『玉鋼の刀』を量産する。 車が動かないなら、飛脚のネットワークを再構築して情報を独占する。 自衛隊の生き残りであるクールな女性自衛官・三笠（みかさ）と協力し、彼は失われた技術で防衛線を構築していく。 『文明リセット』のレベルが上がると、戻せる時代はさらに古くなるらしいが……。 果たして彼は、この崩壊した世界で新たな『文明』の礎となれるのか。