警視庁捜査一課の星野凛奈警部補 は、東京の地下鉄で発生した連続爆弾騒ぎを追う 。犯人が残した高度な暗号が解読され 、「新宿駅。明日。正午。心臓は止まる」という未曾有のテロ予告が突きつけられる 。残り48時間 、凛奈はAI画像解析を駆使して犯人の足跡を割り出し 、駅地下深くに隠された軍事レベルの爆弾を発見する 。陸上自衛隊による決死の解体作業が進む一方 、凛奈は犯人がシステムに絶望した元技術者だと突き止め、都庁で対峙する 。凛奈の説得と自衛隊の処置が重なり、爆発残り1秒で大惨事は回避された 。事件後、凛奈は新設されるテロ対策専門部署への推薦を受ける 。