"痕印者（スティグマータ）"――それは身体の一部に幾何学模様の傷痕を刻まれた異能力者たちの呼び名。何事にも熱くなれない男子高校生・赤坂秀彰は『痕印者』と出会い、次第にその強大な力に魅せられていく。退屈だった日常を捨て、自らも痕印者になりたいと望んだ彼に待ち受けていたのは、壮絶な戦いの運命だった――。