飛空艦が空を駆けてから半世紀あまり。 禍艦と呼ばれる高性能飛空艦を有するアウストムネシア帝国が戦端を切り、彗州全土を巻き込んだ魔女戦争の終結から三年。 彗州の西端の島国、エゼルベシア王国でユフ＝ハウェイズは飛空艦の座礁事件に端を発する舌戦でエゼルベシア空中艦隊を免官される。 子供の頃から飛空艦の指揮艦に憧れていたユフは失意に沈み、酒に酔ってあわや大惨事となりかけたところをフィチと名乗る妖精族の少女が助けた。 その次の日、隣国である妖精族の国ベルティナの王女がユフを尋ね、王女と身分を明かしたフィチはユフに自分の伴侶として巡空戦艦『スカアハ』に乗艦してくれと願う。 そしてベルティナに渡ったユフとフィチだが、時同じくして彗州ではとある陰謀が進行していたのだった……。