椚ヶ丘中学校に通っている廉\n廉にはある秘密が…それは六本木のカリスマ灰谷兄弟の弟だということ\n今までA組として優秀だった廉しかし度重なる遅刻や不良行為でE組に落ちてしまう\nE組に落ちた先に待ち受けていたのは月を破壊した超生物を暗殺するという暗殺教室\nそこで廉はさまざまな体験をしていく