現実の仕事に疲れた主人公・ミサキは、癒やしを求めて新作VRMMO『Elysian Sphere Online』を始める。
戦闘は苦手なため、初期スキルで偶然手に入れた生産系スキル『浄化』を使い、誰も寄り付かない寂れた廃村の掃除を始めることにした。

しかし、この『浄化』スキルは、ただの清掃スキルではなかった。
土地にかけられた古代の呪いを解き、穢れたアイテムを伝説級の武具に変え、凶暴化したモンスターを元の神聖な姿に戻す、唯一無二の超レアスキルだったのだ。

本人はただ黙々と掃除に没頭しているだけなのに、浄化した土地からは古代文明が蘇り、助けたNPCはかつての英雄だったことが判明する。
気づけば、サーバー初のユニーククエストを次々とクリアした謎のプレイヤー『聖女』として、他のプレイヤーや運営から神格化されていく。

これは、ただのんびりお掃除がしたかっただけの主人公が、その無自覚な行動で世界をひっくり返していく物語。