とある学園が突如として、異世界に転移した直後、魔物の大群が迫り、あわや学級崩壊の危機に見舞わられた。 　しかし、野球部がゴブリンにボールをぶつけ、ラグビー部がオークの突進を吹き飛ばし、剣道部が竹刀でオーガをぶった斬る。 　そう、ここは文武芸術ありとあらゆる分野に精通した異才を集めた【偉人機構学園】である。 　異才の生徒たちは各々の部活で異世界に侵攻を開始する。 　漫画研究サークルは異世界の文明を謳歌し、飼育部や園芸部は異世界と現代の動植物を掛け合わせ、将棋部とチェス部の指揮の下、サバゲーサークルが騎士団を壊滅させ、黒魔術部と科学部が魔法と科学で無双する。 　個性的で、癖強めな部活員たちが異世界にひしめく中、帰宅部の男子『黒祇 燕倉』は生徒会の義妹『黒祇 静那』に何十回目の"一生のお願い"と命令され、学園の特使となる。 　部活動VS異世界の戦いが今始まる。