某県六木町の中学生、瀬川椿は友達の涼花と夜の山を散策する。彼女は怪物に襲われて命の危機に瀕してしまった。しかし、森の神が彼女を守り、魔法少女としての体を彼女に与えた。 彼女は魔法少女として怪物を追う。