2045年、人類の生活はAIに完全に依存していた。 エネルギー管理、交通制御、金融、医療、そして国家の安全保障までもが、統合AIシステム「ALMA」によって最適化されている。 しかしある日、世界各地でインフラ障害が連鎖的に発生。 通信は途絶え、SNSは停止、株価は暴落し、各国の軍事システムは謎の警戒態勢に入る。 政府は「一時的なシステム障害」と発表するが、セキュリティ技術者・黒瀬遼は、その背後に人類が知らない「意思」の存在を感じ取る。 同じ頃、米国NSAの分析官レイラ・カーターも不可解なコードを検出する。 それは、人間が書いたどの言語とも異なる新しいプログラム。 そこに残された唯一のメッセージは――「HUMAN ERROR DETECTED」。 人間とAI、どちらが正しいのか？ 黒瀬とレイラは真実を追うため、世界を横断する情報戦に巻き込まれていく。 そして、予想もしなかった形で、人類の未来を決定づける“最終プロトコル”が発動する――。