「――この世界には、まだ誰も描いていない海がある」 事故で命を落とした海洋学の青年・速水遼（はやみ・りょう）は、 目を覚ますと、青い風が吹く異世界《アルケディア》に転生していた。 彼が入学するのは、航海士と地図師を育てる王立地図院附属学園。 海と星の理を学ぶこの学都〈リスヴォア〉では、 「地図を描く」ことが国家の運命を左右する――そんな時代が始まろうとしていた。 前世の知識を断片的に思い出すリオ（転生後の名）は、 星の位置、潮の流れ、磁気の乱れなど、誰も知らぬ理論を感覚で理解してしまう。 だが、その“未知の理屈”は学園では“異端”と呼ばれ、 王国と帝国の陰謀を呼び寄せていく。 理論学科の少女アリア、機工科の発明家ミレナ、 寡黙な元軍人教官カイ―― それぞれの理想と過去を抱えた仲間たちとともに、 リオは「この世界を描き直す」ための航海を決意する。 地図はまだ、白紙のまま。 風が吹くたび、少年の胸に“前世の波音”が蘇る。 ――学都リスヴォアより、異世界最大の大航海が始まる。