光の魔法少女・白鳥ミサキは、学校で出会った紫雲院トウヤ先輩に恋をする。だが彼の正体は、倒すべき敵である闇の魔法使いだった。戦えない二人は葛藤しながらも、光と闇が本当は敵ではないという真実を知り、世界を変える。