現代を生きる少年「紅ユウキ」は突如現れた謎のロボット「ブジンカイザー」に異世界へと連れ去られてしまう。成り行きで異世界を救うことになったユウキはブジンカイザーに乗り込み「傀儡」と呼ばれる謎の生物と戦うこととなる。全ての傀儡を殲滅し、世界を平和へと導けブジンカイザー！