夜になると、黒い化け物“夜喰”が現れる。 そんな世界で、不登校の少年・会田雪斗は、両親と喧嘩し家を飛び出してしまう。 だが、新月の夜――夜喰が現れ、雪斗は命を落としかける。 助けに現れたのは、黒い袴と仮面で身を包んだ男。 総理直属の討伐組織「八咫烏」の隊長・咲間未来だった。 夜喰に触れたはずなのに、炭化しない雪斗。 その異常な体質が、夜の理に隠された“神話の扉”を開いていく――。