古びた集落で幸せに暮らしていた少女、琴吹ほのこは、ある日謎の男に術をかけられ、家族や共に過ごしていた村の人々に存在を忘れられてしまう。 混乱しているところに現れた一色大和と名乗る少年に連れられ、ほのこは”緋桜組”と呼ばれる組織に拾われることとなった。 その組織は「悪しき怪を天へと帰し、この国の平穏を取り戻す」ために刀を振る集団であった。 家族や仲間たちに自分の存在を忘れさせた張本人である、謎の男を探すためには手助けが必要。 ほのこは、ひと月後に行われるという緋桜組の入隊試験に向け、猛鍛錬を始めることとなった——。