遥か遠い未来、東歴999年。 世界統一を果たした統合政府によって作られた文明規制法により1000年間文明の進歩がない世界。 先の大戦で造られた自動思考型兵器”アンドロイド”と”業使い”と呼ばれる異能力者、そして人間が共存する世界線。 統合政府第258ブロック東京都八王子市に住む普通の小学生須藤ミナトは、空から飛んできた謎の声の持ち主ガイアの力により突如業使いとなる。 警察省八王子警察署アンドロイド犯罪対策係所属のアンドロイド、乙神レイとの出会いもあり様々なアンドロイド犯罪事件を解決していくのだが、その先には世界を巻き込む闇が存在していた。